Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nemp1Q6ZQE4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms