Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M2Q6W9L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M2Q6W9L1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms