Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn5Q6VZZ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn5Q6VZZ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms