Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300ld3Q6SJQ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms