Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bnip1Q6QD59 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnip1Q6QD59 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms