Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms