Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmeff1Q6PFE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmeff1Q6PFE7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms