Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup98Q6PFD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup98Q6PFD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup98Q6PFD9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms