Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE84

Stoml3, Stomatin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stoml3Q6PE84 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stoml3Q6PE84 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stoml3Q6PE84 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms