Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2surpQ6NV83 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms