Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RragbQ6NTA4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RragbQ6NTA4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms