Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltv1Q6NSQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltv1Q6NSQ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms