Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm4Q6IRU2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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