Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud6aQ6IE21 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6aQ6IE21 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms