Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw2Q6I6G8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw2Q6I6G8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms