Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Best3Q6H1V1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Best3Q6H1V1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Best3Q6H1V1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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