Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6GQU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6GQU0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6GQU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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