Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Carmil1Q6EDY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil1Q6EDY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Carmil1Q6EDY6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms