Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf8Q6DID3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms