Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp11bQ6DFW5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp11bQ6DFW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms