Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nop58Q6DFW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms