Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Cntn4Q69Z26 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntn4Q69Z26 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms