Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sptbn2Q68FG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms