Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Top2bQ64511 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Top2bQ64511 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Top2bQ64511 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms