Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sall3Q62255 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sall3Q62255 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms