Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox19Q62249 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms