Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3a2Q62203 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms