Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rbm38Q62176 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm38Q62176 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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