Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd1Q62101 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd1Q62101 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms