Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne1Q61457 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne1Q61457 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms