Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Arhgef1Q61210 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef1Q61210 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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