Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xrcc1Q60596 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc1Q60596 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc1Q60596 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms