Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sin3aQ60520 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sin3aQ60520 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sin3aQ60520 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms