Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf15Q5UBV8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms