Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NotoQ5TIS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NotoQ5TIS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NotoQ5TIS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NotoQ5TIS6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms