Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r195Q5SVD6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r195Q5SVD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms