Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd40Q5SUE8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms