Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sun3Q5SS91 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sun3Q5SS91 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sun3Q5SS91 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sun3Q5SS91 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sun3Q5SS91 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sun3Q5SS91 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sun3Q5SS91 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms