Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms