Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms