Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsrp1Q5NCR9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsrp1Q5NCR9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms