Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CoblQ5NBX1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms