Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prkaa1Q5EG47 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms