Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tigd5Q499M4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tigd5Q499M4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms