Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2Q3V1H1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2Q3V1H1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms