Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UZV7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UZV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3UZV7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms