Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc114Q3UX62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.1 ms