Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn13Q3UW68 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn13Q3UW68 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms