Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom2Q3UUY6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms