Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUX7

Uncharacterized protein C4orf46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UUX7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UUX7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UUX7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UUX7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UUX7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UUX7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UUX7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms